Ils pratiquent aujourd'hui la religion de Danyi-Piilo (tout comme d'autres tribus de l'Arunachal Pradesh). Ils vouent un culte au soleil (Ayo Danyii) et à la lune (Atoh Piilo). Ils croient que les événements néfastes sont causés par des mauvais esprits et ils essayent alors de les apaiser par des sacrifices de poulet, de vache et d'autres animaux. Ils croient aussi que les différents groupes ethniques de l'Arunchal Pradesh partagent un même ancêtre : Abotani.

Les femmes ont pour coutume d'orner leurs narines avec des disques de rotin noirci. On appelle cela un yabinghulo. Cette pratique serait née quand une femme apatani ne voulut plus paraître attirante aux hommes des tribus environnantes. Les habits apatani sont élaborés et colorés. Les tatouages sont très populaires.

Les Apatanis donnent un statut social plus élevé à l'homme qu'à la femme bien que les deux sexes partagent les responsabilités pour s'occuper de la maison et de la famille.

Les Apatanis pratiquent la riziculture. Ils sont réputés dans la région par leur système d'irrigation très sophistiqué.